益气滋阴饮治疗2型糖尿病活性成分的虚拟筛选研究(1)
摘 要 目的:對中药方剂益气滋阴饮治疗2型糖尿病的活性成分、作用靶标和途径进行虚拟筛选研究,从分子水平上阐述该方治疗2型糖尿病的药效机制,为其推广应用和合理组方提供理论依据。方法:从《中药原植物化学成分手册》中检索出益气滋阴饮方剂10味药材中已分离得到的化学成分,从DrugBank数据库中检索出治疗2型糖尿病的药物/类药分子,在PubChem Compound数据库中下载各成分的三维分子结构,在Cerius2 4.10软件中对其进行结构优化,建立益气滋阴饮小分子化合物数据集;以“type 2 diabetes mellitus”为关键词,在治疗靶蛋白数据库中搜索及筛选出2型糖尿病的靶标蛋白,然后从治疗靶蛋白数据库中查询并下载这些蛋白质的三维立体结构;将选出的化合物分子(配体)与靶标蛋白(受体)进行对接,找出活性较高(根据Degree值与Betweenness值大小排序)的小分子和相关度较高的靶标蛋白;以筛选出的小分子化合物与靶标蛋白(如N-反式-咖啡酰酪胺分子与糖原合成酶激酶-3β)的精细对接为例,讨论配体与受体间的相互作用机制。结果:检索得到化学成分及药物/类药分子分别为732、127个,筛选出2型糖尿病的靶标蛋白30个;根据Degree值与Betweenness值大小排序 ......
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