中圖分类号 R914.2 文献标志码 A 文章编号 1001-0408(2019)16-2199-07

    DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2019.16.08

    摘 要 目的：筛选潜在的真核生物延伸因子2激酶(eEF2K)抑制剂小分子，为eEF2K抑制剂的设计和研发提供参考。方法：采用同源模建技术构建eEF2K蛋白晶体结构模型，并进行Loop优化和分子动力学优化，借助SAVES在线服务器从Verify_3D、EERAT和拉氏图等3个方面对上述模型进行评估。收集55个eEF2K抑制剂小分子，使用Insight Ⅱ软件以其中的28个(编号为奇数，设为训练集)为基础构建具有活性预测能力的Hypogen药效团模型，以另外27个(编号为偶数，设为测试集)进行验证，通过拟合活性[即半数抑制浓度的负对数(pIC50)]预测值与真实值并借助Ligand profiler热图筛选最优药效团模型。结合上述药效团模型和Lipinski五规则、分子对接方法进行eEF2K抑制剂小分子的虚拟筛选。结果与结论：所建eEF2K蛋白晶体结构模型的整体质量因素得分为93.697 ......