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编号:13174663
福建金线莲与菌根真菌互作过程中的蛋白质组研究(2)
http://www.100md.com 2012年12月15日 《中国中药杂志》 2012年第24期
     以已知精确浓度的BSA为标准,按2-D Quant Kit试剂盒提供的方法定量。

    2.2 双向电泳及质谱分析 参照有关方法[7]进行双向电泳,图像分析用PDQuest双向电泳凝胶图像分析软件。蛋白质点分子量根据同步电泳的标准蛋白的位置计算,等电点按所用IEF胶条的pH 3~10估计,并通过软件获取每个蛋白点的丰度值。采用德国Bruker公司ReFlex TMIII型基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪。

    2.3 数据库查询 登陆http://www.matrixscience.com,用Mascot程序对MALDI-TOF质谱检测得到的肽质量指纹图谱(peptide mass Fingerprint, PMFs)进行检索。数据库选NCBInr或Swiss-prot,种属选Viridiplantae(Green Plant),氨基酸固定修饰方式选择Carbamidomethyl(C)修饰、可能的修饰方式选Oxidation(M)修饰。检索时选取单同位素峰,可接受的肽段分子量误差设为0.3 Da ......
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