基于高通量测序的红豆杉EST SSRs标记研究(2)
3 结果与分析3.1 Total RNA提取和反转录 以十五年生针叶为材料,对获取的Total RNA采用Oligotex mRNA Midi Kits纯化mRNA,在操作中对实验流程作了适当的修改,重复用Buffer OBB洗1次,大大提高了mRNA纯化效率,分离纯化后的mRNA经核酸定量仪测定A,所得的mRNA纯度较高,质量和数量为构建高质量cDNA文库提供了保证。为了得到全长cDNA,本实验采用了Clontech SMART PCR cDNA合成试剂盒。在cDNA合成引物3′SMART CDS PrimerⅡA和SMART ⅡA 寡核苷酸引物存在下,以0.8~1.0 μg mRNA为模板合成cDNA 1st链。接着采用Clontech Advantage 2 PCR Kits进行长链PCR扩增,合成cDNA 2nd链。为了获得二链合成最佳反应循环数,各取4 μL二链合成反应液电泳检测,最后确定最佳二链循环数为13 次循环(图1)。
M.Marker;9~15.循环数 ......
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