黄芪与其混伪品的ITS序列分子鉴定研究(2)
2.4 测序 经过PCR扩增后,PCR原产物由北京擎科新业生物技术有限公司测序部测序,各样品均采用正向测序。2.5 序列分析 将7种药材的24个个体进行序列的比对分析,所得DNA序列用CONTIG软件同源对齐,并辅以人工校对。以尽量减少排列所缺失的数目; 排序后的序列使用BioEdit分析软件进行分析处理。用MEGA 4分别计算各样品ITS序列的差异性(Kimura 2-parameter ), 并采用邻接法(NJ法) 和非加权平均法(UPGMA法)分别构建了系统发育树。构建系统发育树,并以Bootstrap作1 000次可信度分析。
3 结果与讨论
3.1 黄芪与其混伪品的ITS序列特征 本实验测得了黄芪与其混伪品的19份样品ITS序列,ITS全序列长度为646~728 bp,分别为蒙古黄芪646~650 bp,其中(G+C)%为53.08%~53.10%; 膜荚黄芪为646~650 bp,其中(G+C)%为53.08%~53.10%;红芪为664 bp,其中(G+C)%为53.77%;紫花苜蓿为659 bp,其中(G+C)%为48.26%;蜀葵为728 bp ......
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