甘草鲨烯合酶基因多态性对其编码酶催化效率影响的研究(3)
3 结果3.1 甘草SQS1和SQS2基因编码区序列克隆和测序
从19株甘草个体中得到12条SQS1基因编码区序列和5条SQS2基因编码区序列,按照英文字母顺序对其进行编号,并在GenBank中注册,见表4。
3.2 SQS1基因编码区多态性分析
获得的12条SQS1序列,其多态性可分为下列类型:①单核苷酸多态性(SNPs):甘草SQS1编码序列中共有22个位点存在SNPs,其中7个位点发生A/G转换,8个位点发生C/T转换,2个位点发生A/C颠换,3个位点发生A/T颠换,1个位点发生C/G颠换,1个位点发生T/G颠换。除495,606,1 117 bp处为同义突变外,其他均为错义突变,错义突变率为80.9%。②插入/缺失长度多态性(InDel):甘草SQS1编码序列中存在1处InDel,SQS1H和SQS1L在738~740位缺失GGA3个碱基,导致酶的长度缩短一个氨基酸。③无义突变:甘草SQS1编码序列中存在1处无义突变。由于1 231位碱基C突变成T,SQS1J和SQS1K基因提前出现终止密码子TAA,导致酶的长度缩短3个氨基酸。④选择性剪接多态性(AS):选择性剪接是真核细胞一种重要的mRNA转录后加工机制 ......
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