甘草3羟基3甲基戊二酰辅酶A还原酶基因多态性与甘草酸含量的相关性分析(1)
甘草3羟基3甲基戊二酰辅酶A还原酶基因多态性与甘草酸含量的相关性分析,3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR),逆转录,RT-PCR,生物信息学
[摘要] 目的:揭示甘草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因的多态性,并阐述HMGR基因多态性与甘草酸含量的相关性。方法:以甘草酸含量差异显著的甘草个体为材料,通过RT-PCR法扩增其HMGR基因编码区;与载体pMD19-T连接后克隆测序;通过多重比对进行HMGR基因多态性分析,及与甘草酸含量之间的关联分析。结果:HMGR基因编码区多态性包括整码突变、碱基置换突变、拷贝数多态性及等位基因杂合;HMGR编码氨基酸序列中存在以下4种类型变异,即-HSL,-HSV,GALLV,GALSV,其中-HSV型为甘草中普遍存在类型,-HSL型为甘草酸低含量甘草的特有类型,GALSV型为甘草酸高含量甘草特有类型。结论:甘草HMGR基因编码区具有丰富的多态性,和甘草酸含量之间具有相关性。[关键词] 甘草;3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR);基因多态性;逆转录;RT-PCR;生物信息学
[稿件编号] 20121106005
[基金项目] 国家自然科学基金项目(81072988)
[通信作者] *刘春生 ......
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