2.3蛋白结构分析利用COPMA软件对IspE，IspH蛋白的二级结构进行预测，同时也对LJIspE，LJIspH蛋白三维结构，残基组成进行了预测。通过比较LJIspE，LJCIspE，LHIspE，LDIspE蛋白的二级结构，推测LJIspE，LJCIspE，LDIspE的结构较为接近(表2)。通过比较LJIspH，LJCIspH，LHIspH，LDIspH蛋白的二级结构，可知LJIspH，LJCIspH的二级结构基本相同，且与LDIspH的结构较为接近(表3)。

    2.4系统进化分析分别从NCBI的Nr数据库中选取已明确功能的IspE，IspH基因编码蛋白进行系统进化分析。LJIspE，LJCIspE，LHIspE，LDIspE蛋白聚为一类，且与所选择基因中的甜菊Stevia rebaudiana、马铃薯Solanum lycopersicum、烟草Nicotiana benthamiana的IspE的关系相对更密切 ......