基于大量前期研究结果[12，33-50]，中药材DNA条形码分子鉴定法选用ITS2和psbA-trnH作为植物类药材的核心条形码，COI和ITS2作为动物类中药材的核心条形码。

    2.2 中药材DNA 提取方法的确定

    2.2.1 植物基因组DNA提取方法的确定依据 植物基因组DNA提取方法较多，常用基于CTAB原理的试剂盒法和改良的CTAB法[51]。应用不同公司植物基因组DNA提取试剂盒等提取中药材基因组DNA，结果表明试剂盒法适用于中药材基因组DNA的提取。由于中药材所含成分复杂，可针对不同入药部位改进DNA提取试剂盒方法[52]。

    常用液氮研磨和球磨仪(钢珠法)法来粉碎样品，液氮研磨的优点是保持低温状态，防止DNA降解，缺点是耗时且在样品种类较多时，容易产生交叉污染。球磨仪的优点是可以同时粉碎多份样品，有效避免样品间的污染。

    针对根及根茎、花、果实、种子和皮类等药材质地，确定各自合适的样品量。通过对2 373份药材样品的DNA提取实验，叶类、花类药材取样量约10～20 Mg²⁺ ......