3.2 网络规模的说明

    本文共涉及2010年版《中国药典》记载的453种中药， 但所构建的网络只有186个点，其原因是很多药物与其他药物在去除高频成分后的相似成分数目小于3个，导致这个原因的因素主要有2个：①目前很多药物具有的、已明确的药物化学成分数目较少。例如佛手只有7个成分，其中黄酮类成分3，5，6-三羟基-4′，7-二甲氧基黄酮和3，5，6-三羟基-4′，7-二甲氧基黄酮为佛手单独所有，其他5个化学成分为其他药物共同所有，但是没有一种其他药物与佛手重叠的化学成分数目大于3，从某种程度上来说，与佛手在5个化学成分中能够重叠2个就足以说明与佛手在化学成分上的相似度。采用一刀切的阈值过滤方法来简化构建网络的过程，代价是丢失了一些诸如佛手这类化学成分种类少的药物，不过这类药物也往往出现在网络的边缘，即使舍去也不会对整个网络的结构产生影响，相反还简化了分析的难度，明晰了药物之间的关系。②一些植物药的化学成分在植物进化过程中长期异化而来，这些药物除了一些高重复度的化学成分，剩下的化学成分和任何药物都极少相似，虽然这些成分进入人体后也会作用在相同的靶点上，但是从数据统计的角度无法计算，需要进一步的归类简化为相同的化学成分进行研究 ......