2.3 SmCM1生物信息学分析 将测序所得的全长cDNA序列在NCBI网站Blast，搜索核苷酸和蛋白质序列，并在线翻译成氨基酸序列，应用ORF Finder(http：//www.ncbi.nlm.nib.gov/gorf/gorf.html) 查找开放阅读框。在Protpatam(http：//expasy.ch/tools/protparam)对丹参中的分支酸变位酶进行理化性质分析，应用CCD进行功能域预测，InterProScan(http：//www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/)预测蛋白结构域，利用CFSSP prediction Server(http：//www.biogem.org/tool/chou-fasman/)进行二级结构预测。利用 Swiss Model(http：//www.expasy.org/swissmod/SWISS-MODEL.html)进行蛋白质三级结构预测及同源建模，利用Swiss PDB Viewer软件标注SmCM1结构域 ......