丹参SmNAC1基因的克隆和生物信息学分析(1)
关键词:丹参SmNAC1基因的克隆和生物信息学分析,NAC转录因子,SmBF3-2,分子克隆
[摘要] 为了研究丹参中特有的NAC转录子在丹参生长发育、激素调节和抗逆胁迫应答调节中的功能,对丹参NAC转录因子进行了克隆和分析。根据丹参毛状根cDNA文库中筛选到的NAC EST序列,克隆了丹参SmNAC1的cDNA全长序列。生物信息学分析显示基因的开放阅读框591 bp,编码166个氨基酸,相对分子质量21.66 kDa,等电点4.36 Genbank kF006346。SmNAC1蛋白的N-端具有保守的NAC_AB结构域,C-端高度变异。根据软件预测SmNAC1可能定位在细胞核。qRT-PCR分析YE+Ag+处理后SmNAC1在丹参毛状根中的表达变化,处理后2 h表达量上调至对照的1.5倍,4~12 h保持2倍的表达量,36 h时下降至对照水平以下,推测SmNAC1可能参与了丹参毛状根对YE+Ag+的胁迫应答调节。
[关键词] 丹参;NAC转录因子;SmBF3-2;分子克隆;生物信息学
NAC转录因子是植物中最大的转录因子家族,在植物的生长调节以及逆境应答分子网络中扮演着极其重要的角色 ......
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