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编号:13154383
红白忍冬SABATH甲基转移酶基因克隆及其生物信息学分析(3)
http://www.100md.com 2013年8月15日 《中国中药杂志》 2013年第16期
     2.4 r LjSABATHMT 基因结构分析 从 rLjSABATHMT 基因ORF两侧设计引物Lj-A1.F和Lj-A1.R对忍冬和红白忍冬基因组DNA进行扩增, 得到约2 000 bp的序列,克隆测序后与其cDNA序列进行比对,发现忍冬 LjSABATHMT 和红白忍冬 rLjSABATHMT 都有2个内含子。2个内含子分别为93,184 bp,均位于0相位,见图3。其中 rLjSABATHMT 内含子1和2的AT量分别为72%,71%,远大于GC量,符合一般的内含子规则;但其内含子/外显子边界剪接方式分别为GA/TC及TT/GG,与常规的GT/AG及AT/AC剪切方式不同。

    2.5 SABATHMT 同源基因表达分析 选择忍冬及红白忍冬 SABATHMT 同源基因的共有序列设计特异性引物,利用RT-PCR 分析了 SABATHMT 同源基因在忍冬与红白忍冬的根、茎、叶中的表达量及花蕾期、盛花期、败花期的表达特性 ......
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