红白忍冬SABATH甲基转移酶基因克隆及其生物信息学分析(4)
内含子对基因表达的影响已得到公认[18],通过其motif与转录因子结合,可以影响前体mRNA合成[19-20]、调节基因代谢[21],从而增强或抑制基因的表达。通过Softberry软件对 SABATHMT 同源基因内含子motif进行预测,结果表明该基因的第1个内含子含有6个调控元件,第2个内含子含有3个调控元件,见表4。
忍冬和红白忍冬内含子motif除ACCTAGCATTT在忍冬和红白忍冬克隆中完全保守外均含有位点变异。Motif元件位点变异频率在忍冬和红白忍冬有所不同,内含子1中的motif (Motif 1,Motif 2,Motif 3,Motif 4,Motif 5)均在红白忍冬中具有丰富的变异,而内含子2中的motif在忍冬中的变异频率比红白忍冬中大。其中,Motif 2和Motif 4只在红白忍冬中具有位点变异而在所有忍冬个体中均非常保守 ......
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