地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1的克隆和表达分析(2)
PCR产物经过加A反应,纯化回收后连接到载体pMD18-T vector(Takara,大连)上,送到深圳华大基因研究院测序。1.4序列特征分析 以NCBI在线分析工具ORF Finder(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)查找基因开放阅读框(ORF)。应用SMART在线工具(http://smart.embl.de/)分析氨基酸序列结构域,相似性搜索应用NCBI在线软件BLAST(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)进行。氨基酸多序列联配用Clustal Omega(http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/),进化树构建利用在线分析软件MAFFT(http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/mafft/) ......
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