三七皂苷类成分的蛋白质相互作用网络分析(2)
2.3 三七皂苷类成分蛋白互作网络的构建及模块分析 三七皂苷类成分的蛋白互作网络见图1。该网络包含189个节点,721条边。对蛋白互作网络进行模块分析,共识别出14个模块,见图1,其中各个模块包含的蛋白质见表2。运用BinGO对各个模块中包含的蛋白质进行分类并进行功能注释,每个模块参与的主要生物过程见表3。3 讨论
复杂系统的一个重要特性就是“模块性”(modularity),这种特性表现为模块内部的节点连接比较稠密,模块间的节点连接比较稀疏。通过对这种特性的研究可以更好的帮助理解复杂系统的机能和特性,且对复杂系统的控制、预测、变化和发展都具有至关重要的意义。本研究运用MCODE算法对三七皂苷PIN进行模块识别,MCODE算法会对每一个识别出的模块进行打分排序,分数越高说明该模块中蛋白质的关联程度越强。打分值高于3的模块共有6个,本文对与心脑血管疾病密切相关的主要功能模块进行讨论。
模块1,3主要与环磷酸腺苷的代谢有关。模块1,3主要包含腺苷酸环化酶家族受体及腺苷A受体,其中腺苷酸环化酶受体及腺苷A受体均能催化ATP产生cAMP。环磷酸腺苷(cAMP)是细胞内参与调节物质代谢和生物学功能的重要物质 ......
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