新疆紫草AP2/ERF转录因子的电子克隆和生物信息学分析(2)
2.4 新疆紫草AP2/ERF蛋白质跨膜结构预测 利用在线跨膜蛋白结构预测TMpred软件,基于蛋白数据库,对AeAP2/ERF蛋白氨基酸的跨膜结构域进行预测的结果见图3。一般而言,纵坐标分值(score)大于500被认为是可能性较高的跨膜结构[28](横坐标表示205个氨基酸),图3显示该蛋白没有内到外螺旋和外到内的螺旋,即未形成跨膜螺旋区域,说明该蛋白可能不具有跨膜转运信号,不会与生物膜结合参与到信号传递过程中。2.5 新疆紫草AP2/ERF蛋白的亚细胞定位 使用Psort在线软件,基于蛋白数据库,对AeAP2/ERF蛋白进行亚细胞定位其在细胞中的定位。结果显示,AeAP2/ERF蛋白质在细胞核的概率最大,达到70%,远大于在溶酶体10%、线粒体基质10%和内质网(膜)10%等的概率,说明新疆紫草AP2/ERF蛋白很可能定位于细胞核。
2.6 新疆紫草AP2/ERF蛋白信号肽预测与分析 采用SignaIP 4.1 Server,基于蛋白数据库,预测新疆紫草AP2/ERF的信号肽 ......
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