基于随机森林算法的川芎成分—靶点—疾病网络的预测研究(1)
基于随机森林算法的川芎成分—靶点—疾病网络的预测研究,网络药理学,靶点预测,心脑血管疾病
[摘要] 该研究搜集KEGG数据库中小分子药物及其酶、离子通道、G蛋白、核蛋白等4类药靶数据作为训练集,建立基于随机森林法的药物-靶点相互作用模型;采用十折交叉验证评价模型精度,获得4类药靶模型的预测正确率分别为71.34%,67.08%,73.17%,67.83%。利用该模型对川芎26个化学成分进行靶点预测,并构建其成分-靶点-疾病网络,所得结果得到了较好的文献验证。该文所建模型具有较高的预测精度,可用于发现其他中药成分的潜在作用靶点。[关键词] 网络药理学;靶点预测;川芎;心脑血管疾病
川芎为伞形科植物川芎Ligusticum chuanxiong Hort.的干燥根茎,具活血行气、祛风止痛的功效,对心脑血管系统、神经系统等疾病有独特的疗效[1],但其药理作用分子机制尚不明确。中药网络药理学研究立足于中药已知化学成分及相关疾病靶标,用计算方法研究中药化学成分的多靶标、多途径协同作用,并用网络拓扑图的形式直观呈现[2]。中药网络药理学初步揭示中药成分复杂作用机制 ......
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