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编号:12624142
丹红注射液作用机制的计算机系统生物学研究(3)
http://www.100md.com 2015年2月1日 中国中药杂志 2015年第3期
     A. 丹参多成分-蛋白网络;B. 红花多成分-蛋白网络;C. 丹红注射液多成分-蛋白网络。网络中蛋白以基因名为词条。

    图1丹参、红花、丹红注射液多成分-蛋白网络

    Fig.1Salviae Miltiorrhizae Radix et Rhizoma, Carthami Flos, Danhong injection multi-compounds-proteins network

    2.2丹红注射液蛋白相互作用网络的分析通过查询相互作用蛋白,发现其中的64个蛋白具有相互作用(图2A),其中4个蛋白分别两两相互作用,其余60个结点构成无孤立结点的蛋白相互作用网络。通过ClusterONE对60个无孤立结点的蛋白相互作用网络进行富集,提取出1个P<0.05具有显著性差异的子网络(图2B)。这1个网络代表了丹红注射液蛋白相互作用网络中的高连接区部分,所提取的子网络是通过曼-惠特尼U检验进行打分,将网络与其外部的网络进行比较,P越低表示内网络比外网络存在差异。对有显著性差异的子网络进行分析,将子网络中的蛋白作为关键蛋白,并映射在KEGG信号通路上。关键蛋白涉及的信号通路有Nod样受体信号转导通路 ......
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