DNA条形码技术在常见中药材蛇类鉴别中的应用(3)
2.2 种间及种内的遗传距离 在MEGA 6.05软件中应用Kimura双参数法计算种内和种间的遗传距离,见表2。可以看出,全部19种蛇类的种内K2P遗传距离平均为2.6%,其中种内平均遗传距离最大的物种为白唇竹叶青T. albolabris(18.5%),其次是乌梢蛇P. dhumnades(9.2%),赤练蛇L.rufozonatus(2.3%),这些物种的种内平均遗传距离均已超Hebert 等[2]所推荐的物种鉴定最小种间遗传距离2%。三索颌腔蛇C. radiatus和眼镜蛇N. naja种间的遗传距离最大,达23.7%,最小的是烙铁头P. mucrosquamatus和白唇竹叶青T. albolabris种间平均遗传距离是9.3%。2.3 系统发育树 基于COⅠ序列,采用邻接法(NJ)方法构建19种的109个常见中药材样品的系统发育树见图1,可以看出分成两大支,水蛇科Homalopsidae为一支,剩下其他5科(蟒科Pythonidae、眼镜蛇科Elapidae、游蛇科Colubridae、水游蛇科Natricidae和蝰蛇科Viperidae)并为一支,节点支持率为98%。在支系Ⅰ中,蟒科Pythonidae的所有缅甸蟒P. bivittatus的样品构成单系 ......
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