桂枝茯苓方治疗痛经、盆腔炎以及子宫肌瘤的活性成分和分子作用机制研究(2)
1材料与方法1.1桂枝茯苓方所含成分的收集从Universal Natural Products Database(UNPD,http://pkuxxj.pku.edu.cn/UNPD)检索桂枝、茯苓、赤芍、牡丹皮、桃仁等5味药材,得到460个小分子化合物,采用Open Babel[5](2.3.2 version,http://openbabel.org)软件进行分子加氢后,选用MMFF94力场进行构象优化,优化时能量阈值设定为1×10-3 J·mol-1。
1.2分子对接本研究利用分子对接方法对桂枝茯苓方作用靶点进行筛选。由于桂枝茯苓方临床上可用于痛经、盆腔炎和子宫肌瘤等妇科疾病,据此以dysmenorrhea,dysmenorrhoea,hysteromyoma,uterine fibroids,pelvic inflammatory disease为检索词,通过Therapeutic Target Database(TTD,http://bidd.nus.edu.sg/group/ttd/TTD.asp) ......
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