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编号:12613402
基于代谢组学技术研究参附配伍对大鼠心脏毒性的影响(3)
http://www.100md.com 2015年4月1日 中国中药杂志2015年第7期
     将LC-MS数据进行PCA和PLS-DA分析。PCA作为一种无监督的模式识别方法,通过将分散在变量中的信息集中到主成分上来描述数据内部结构。得到的PCA得分图直观显示了不同组别下生物体代谢模式的变化,具有相同或者相似状态的样本处于相近的位置。而PLS-DA是一种有监督的模式识别方法,在分析X变量时考虑变量Y矩阵,筛选得到由组间差异而形成的潜在标记物,在显著提高分类判别能力的同时减少了干扰因素对相似性聚类分析的影响。结果显示,空白组、参附合煎组和参附合并组样本基本分离,而且各组样本点之间聚集良好,说明大鼠在灌胃给予参附合煎液、参附合并液之后体内内源性代谢物发生了较明显的改变,结果见图2。

    变量重要性投影(variable importance projection,VIP)是用于评价潜在标记物的一个变量,通过偏最小二乘判别分析计算VIP,取VIP>1时,共发现187个生物标示物,通过HMDB数据库在线检索得到可能的标志物15个,以及在不同组别中相对含量的变化见表1。

    对相对含量的数据进行进一步的One-Way ANOVA统计分析可以得到 ......
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