利用网络药理学方法研究芪桂痛风片的药效物质基础与分子作用机制(3)
2.2网络构建与分析利用AutoDock4.0将芪桂痛风片中的423个化合物和25个与嘌呤分解代谢、炎症和免疫调节相关靶点蛋白(表1)进行分子对接,从分子对接结果中抽提对接打分高于原配体且不小于6的化合物及其作用的靶点蛋白,最终获得112个化合物及22个靶点蛋白。将化合物和靶点蛋白导入Cytoscape网络分析软件,构建芪桂痛风片分子与靶蛋白作用网络(图2),其中分子、靶蛋白用节点(node)表示,边(edge)表示分子与靶蛋白间的相互关系,某个分子与某个靶蛋白存在相互作用,则它们就会通过edge连接起来。通过分析D-T网络可以发现芪桂痛风片中既存在一个分子与多个靶蛋白存在较强相互作用,也存在不同分子作用同一个靶蛋白的现象,显示了芪桂痛风片的多成分、多靶点相互作用的特点,也正符合了中药作用的特点。节点的网络度(degree)和介数(betweenness)常用于网络特征分析以评估生物网络中的药物和作用靶点的重要性。
由于痛风性关节炎是以高尿酸血症为生化基础,尿酸结晶又可通过多种免疫机制介导炎症的发生[13] ......
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