罂粟属植物核心DNA条形码的筛选(1)
[摘要] DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种准确、高效且对操作人员要求不高的物种鉴定技术。为了筛选出适合罂粟属的DNA条形码，从GenBank上获得罂粟属植物共69条序列，包括21条ITS序列，10条matK序列，8条psbA-trnH序列，14条rbcL序列和16条trnL-trnF序列。应用Mega 6.0软件分析了罂粟属的ITS，matK，psbA-trnH，rbcL，trnL-trnF序列的特征，通过计算序列的种内、种间距离，评估序列的Barcoding Gap和构建NJ，UPGMA系统发育树进行分析。分析结果表明：trnL-trnF不仅种内变异和种间变异差别最大，而且有明显的barcoding gap，种内变异和种间变异重合较少，能较好地区分不同种类的罂粟;所构建的NJ和UPGMA系统发育树，也能将全部物种区分开。综合考虑，建议把trnL-trnF作为鉴定罂粟属植物的核心条形码 ......
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