基于受体药效团的CETP天然抑制剂的发现研究(4)
疏水相互作用ALA202,VAL198,CYS13,PHE441,LEU261
静电相互作用HIS232,ARG201
中药氢键相互作用SER230,HIS232,GLN199,ARG201,VAL198
疏水相互作用VAL198,ALA202,PHE263,CYS13,PHE441
静电相互作用none
3 讨论
本文所构建的最优受体药效团模型以疏水作用特征为主,唯一的氢键受体特征位于PHE263附近;且分子对接结果表明,中药化合物和阳性化合物与蛋白结构相互作用的氨基酸残基均以疏水性氨基酸为主,且高频氨基酸和关键氨基酸在相互作用种类和位置上均较为相似。结合文献中的分子对接结果[6],配体与CETP蛋白之间的作用以疏水作用为主 ......
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静电相互作用HIS232,ARG201
中药氢键相互作用SER230,HIS232,GLN199,ARG201,VAL198
疏水相互作用VAL198,ALA202,PHE263,CYS13,PHE441
静电相互作用none
3 讨论
本文所构建的最优受体药效团模型以疏水作用特征为主,唯一的氢键受体特征位于PHE263附近;且分子对接结果表明,中药化合物和阳性化合物与蛋白结构相互作用的氨基酸残基均以疏水性氨基酸为主,且高频氨基酸和关键氨基酸在相互作用种类和位置上均较为相似。结合文献中的分子对接结果[6],配体与CETP蛋白之间的作用以疏水作用为主 ......
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