基于基因表达谱与分子指纹技术研究复方丹参滴丸治疗颈动脉粥样硬化的物质基础和作用机制(3)
2.5分子结构相似性比较Johnson和Maggiora提出了相似性质定律，即相似结构的化合物往往有相似的性质(similarattractssimilar)[12]。因此，对复方丹参滴丸的成分与Cmap中分析得到的药物分子进行结构相似性比较，可以推测复方中能够逆转调控颈动脉粥样硬化差异表达谱的药效成分。分子指纹(molecularfingerprint)是描述化合物结构的一种方法，它通过检测分子结构中一些特定的子结构(即分子结构片段)是否存在，从而把分子结构转化为一系列二进制的指纹序列。在比较2个小分子药物之间的分子指纹时，通常使用经典的Tanimoto系数来量化化合物的相似程度[13]。用PaDEL-Descriptor计算小分子的pubchemfingerprint，然后自编程序计算Tanimoto系数。PaDEL-Descriptor软件由新加坡国立大学Yap[14]等用JAVA语言开发，用于计算分子描述符和分子指纹。Tanimoto系数又称为广义Jaccard系数 ......
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