羌活不同地理种群ITS序列变异及系统发生分析(2)
2方法
2.1基因组DNA的提取与检测依据改良的CTAB法从硅胶干燥的叶片中提取总DNA。通过测定紫外吸光度来确定DNA浓度和纯度。利用08%琼脂糖凝胶电泳检查DNA完整性。
2.2PCR扩增与DNA测序采用真核生物rDNAITS 序列扩增引物ITS Primer A:5′CGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCA3′和ITS Primer B:5′TTCCCTGTTCACTCGCCGTTAC T3′,对羌活和宽叶羌活rDNA ITS序列进行PCR 扩增。反应体系为25 μL,内含25 mmol·L-1 MgCl2 2 μL,25 mmol·L-1 dNTPs 2 μL,10 μmol·L-1引物各06 μL,25 ng 模板,10×buffer 25 μL,1 U Taq DNA 聚合酶(TaKaRa)。使用Eppendorf Mastercycler Gradient PCR仪进行扩增反应, 扩增条件为95 ℃预变性3 min;35个循环:95 ℃变性05 min,51 ℃退火05 min ......
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2.1基因组DNA的提取与检测依据改良的CTAB法从硅胶干燥的叶片中提取总DNA。通过测定紫外吸光度来确定DNA浓度和纯度。利用08%琼脂糖凝胶电泳检查DNA完整性。
2.2PCR扩增与DNA测序采用真核生物rDNAITS 序列扩增引物ITS Primer A:5′CGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCA3′和ITS Primer B:5′TTCCCTGTTCACTCGCCGTTAC T3′,对羌活和宽叶羌活rDNA ITS序列进行PCR 扩增。反应体系为25 μL,内含25 mmol·L-1 MgCl2 2 μL,25 mmol·L-1 dNTPs 2 μL,10 μmol·L-1引物各06 μL,25 ng 模板,10×buffer 25 μL,1 U Taq DNA 聚合酶(TaKaRa)。使用Eppendorf Mastercycler Gradient PCR仪进行扩增反应, 扩增条件为95 ℃预变性3 min;35个循环:95 ℃变性05 min,51 ℃退火05 min ......
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