3种藏药基原植物遗传多样性研究(2)
1.3序列数据分析
各序列起止范围参考GenBank中相关序列,所得序列输入计算机后,用MEGA 503软件进行分析。
2结果
2.1序列的获得
毛萼獐牙菜与齿叶玄参分别各获得30条ITS区克隆序列;直接测序法获得其他93条序列。将所有153条序列上传至GenBank,共获得153个登录号;同时,外类群椭圆叶花锚的ITS区序列也获得登录号,见表3。
2.2遗传多样性分析
2.2.1“莪德哇”遗传多样性及物种鉴定DNA条形码推荐序列的获得全萼秦艽3个单株的ITS区、叶绿体DNA、线粒体DNA序列均分别一致。其中双亲遗传的核基因组ITS区致同进化完全,序列纯合程度高,无杂合位点。
同时,课题组前期已获得西藏地区龙胆属秦艽组全部5个近缘物种(麻花秦艽G straminea、粗壮秦艽G robusta、粗茎秦艽G crassicaulis、西藏秦艽G tibetica、长梗秦艽G waltonii)的所有11种相关序列。结合以上工作积累,与全萼秦艽进行比较分析。结果显示,各物种的trnL和rpoC1序列分别完全一致 ......
您现在查看是摘要页,全文长 4344 字符。
各序列起止范围参考GenBank中相关序列,所得序列输入计算机后,用MEGA 503软件进行分析。
2结果
2.1序列的获得
毛萼獐牙菜与齿叶玄参分别各获得30条ITS区克隆序列;直接测序法获得其他93条序列。将所有153条序列上传至GenBank,共获得153个登录号;同时,外类群椭圆叶花锚的ITS区序列也获得登录号,见表3。
2.2遗传多样性分析
2.2.1“莪德哇”遗传多样性及物种鉴定DNA条形码推荐序列的获得全萼秦艽3个单株的ITS区、叶绿体DNA、线粒体DNA序列均分别一致。其中双亲遗传的核基因组ITS区致同进化完全,序列纯合程度高,无杂合位点。
同时,课题组前期已获得西藏地区龙胆属秦艽组全部5个近缘物种(麻花秦艽G straminea、粗壮秦艽G robusta、粗茎秦艽G crassicaulis、西藏秦艽G tibetica、长梗秦艽G waltonii)的所有11种相关序列。结合以上工作积累,与全萼秦艽进行比较分析。结果显示,各物种的trnL和rpoC1序列分别完全一致 ......
您现在查看是摘要页,全文长 4344 字符。