雷公藤4—(5′—二磷酸胞苷)—2—C—甲基—D—赤藓醇激酶基因的全长克隆与表达分析(3)
3 结果
3.1 雷公藤TwCMK基因的全长克隆及序列分析 通过全长PCR克隆TwCMK全长cDNA,见图1。将所得全长序列进行Blastx比对和ORF Finder 在线分析,测得的序列与其他植物的CMK基因有较高的同源性并且存在完整的开放阅读框。获得全长为1 732 bp的 cDNA序列,开放阅读框位于211~1 374 bp,推测编码387个氨基酸。Blastx结果显示TwCMK序列与美丽帽柱木的同源性为84%,黄瓜同源性为83%,巨桉同源性为82%,可可树同源性达82%,见图2。TwCMK具有较保守的结构域,在DNAMAN 8.0软件中对可可树 (TcCMK, XP_007015325.1),拟南芥 (AtCMK, AEC07908.1),长春花 (CrCMK, ABI35992.1),苜蓿(MtCMK, KEH33384.1),金银花 (LjCMK, AGE10581.1),丹参(SmCMK, ABP96842.1),葡萄 (VvCMK ......
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3.1 雷公藤TwCMK基因的全长克隆及序列分析 通过全长PCR克隆TwCMK全长cDNA,见图1。将所得全长序列进行Blastx比对和ORF Finder 在线分析,测得的序列与其他植物的CMK基因有较高的同源性并且存在完整的开放阅读框。获得全长为1 732 bp的 cDNA序列,开放阅读框位于211~1 374 bp,推测编码387个氨基酸。Blastx结果显示TwCMK序列与美丽帽柱木的同源性为84%,黄瓜同源性为83%,巨桉同源性为82%,可可树同源性达82%,见图2。TwCMK具有较保守的结构域,在DNAMAN 8.0软件中对可可树 (TcCMK, XP_007015325.1),拟南芥 (AtCMK, AEC07908.1),长春花 (CrCMK, ABI35992.1),苜蓿(MtCMK, KEH33384.1),金银花 (LjCMK, AGE10581.1),丹参(SmCMK, ABP96842.1),葡萄 (VvCMK ......
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