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编号:12713476
基于转录组测序揭示适度干旱胁迫对甘草根基因表达的调控(2)
http://www.100md.com 2015年12月15日 《中国中药杂志》 2015年第24期
     1 材料与方法

    1.1 样品 甘草种子购自河北安国中药材市场,经北京中医药大学中药学院魏胜利副教授鉴定为甘草G. uralensis的种子。甘草在盛有营养土与沙土的混合土(体积比1∶1)的花盆中按常规方法栽培。植株生长6个月后采用称重补水法控制土壤含水量。适度干旱胁迫组与对照组甘草栽培的土壤相对含水量分别为40%~45%和70%~75%。30 d后挖取甘草根,洗净后用液氮速冻,置-80 ℃保存。

    1.2 总RNA提取 取甘草根在液氮中研成粉末,用RNAprep Pure多糖多酚植物总RNA提取试剂盒(天根生化科技有限公司,北京)提取总RNA。总RNA经安捷伦2100生物分析仪(安捷伦科技有限公司,美国)检测质量与浓度。每处理3份生物学重复。

    1.3 转录组测序 将每处理3份RNA样品等量混合,由深圳华大基因科技服务有限公司构建测序文库,使用Illumina HiSeq 2000测序平台进行转录组双末端测序。

    1.4 数据分析 去除原始序列数据中含有接头及低质量的序列后 ......
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