基于转录组测序揭示适度干旱胁迫对甘草根基因表达的调控(3)
2.4 半定量RT-PCR 为了验证转录组差异表达基因RPKM分析的可靠性,选取了5个基因进行半定量RT-PCR分析。结果表明,适度干旱胁迫促进了Unigene0105540(T5H),Unigene0065918(CHIⅡ),Unigene0039553(FS),Unigene0064861(IFG)基因的表达,抑制Unigene0005302(I2′H)基因的表达,基因表达模式与转录组RPKM分析结果一致,见图4。
2.5 适度干旱胁迫对甘草根次级代谢相关基因表达的影响 对甘草根转录组中的DEGs分析发现,适度干旱胁迫可促进甘草根中萜类、黄酮类等有效成分生物合成途径的一些关键酶基因的表达,见表3,其中包括萜类生物合成的限速酶3-羟基-3甲基戊二酰辅酶A还原酶(Unigene0050890)、1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(Unigene0041511)和牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(Unigene0079956),黄酮类生物合成的限速酶查耳酮合酶(Unigene0038339)、黄酮醇合酶(Unigene0039553)、类黄酮3′-羟化酶(Unigene0062600)等 ......
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