当归4—香豆酸辅酶A连接酶基因克隆与组织表达分析(3)
2.2.4 全长cDNA序列分析 将测序的cDNA序列用DNAMAN 软件翻译成氨基酸序列,用DNAMAN和NCBI(National Center for Biotechnology Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) 网站上的Blast N和Blast P进行核苷酸序列和氨基酸序列的比对,使用ORF Finder查找开放阅读框(ORF)。2.3 基因表达分析
采用实时荧光定量PCR法测定当归幼苗不同生长阶段4CL基因的组织特异性表达。以测序全长cDNA设计并合成4CL特异性引物P8和P9,以当归18S片段序列(Genbank登录号GU289658)设计并合成一对内参特异性引物P10,P11。以大约200 ng当归cDNA为模板,建立荧光定量PCR反应体系。反应程序参照文献方法进行[16],退火温度调整为58 ℃。用2-ΔΔCt法计算基因相对表达量 ......
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