基于钾离子通道开放的中药降压成分发现研究(2)
采用所构建药效团模型对24个训练集化合物和96个测试集化合物进行匹配，其中测试集化合物包括24个活性化合物和72个非活性化合物，以此对其活性预测能力进行验证，并结合药效团评价参数：活性化合物有效命中率4(%)、辨识有效性指数Ⅳ、综合评价指数CAI等，对药效团优劣进行评价。同时，利用Fisher交叉验证方法，对训练集化合物进行随机化处理，产生10个随机药效团模型，考察所构建的药效团模型是否具有偶然性。
1.2 基于受体结构的药效团模型构建及评价 由于没有已解析的KATP晶体结构，本研究以“ATP-sen-sitive potassium channel”为关键词搜索Protein ModelPortal(PM，http：//www.proteinmodelportal.org)，选择PM编号为PM0079770的KATP同源模建结构为研究对象构建基于受体结构的药效团模型。由于该蛋白暂未有活性位点信息报道，本研究利用DS中Define and Edit Binding Site模块自动搜索受体结构中潜在的活性位点 ......
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1.2 基于受体结构的药效团模型构建及评价 由于没有已解析的KATP晶体结构，本研究以“ATP-sen-sitive potassium channel”为关键词搜索Protein ModelPortal(PM，http：//www.proteinmodelportal.org)，选择PM编号为PM0079770的KATP同源模建结构为研究对象构建基于受体结构的药效团模型。由于该蛋白暂未有活性位点信息报道，本研究利用DS中Define and Edit Binding Site模块自动搜索受体结构中潜在的活性位点 ......
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