药物靶标预测技术在中药网络药理学中的应用(2)
根据预测原理的不同，药物-靶标相互预测技术和策略大致可以分为4类，即基于配体的预测方法、基于靶标的预测方法、机器学习方法、组合应用的预测方法。本文就药物靶标预测方法及其在中药网络药理学的应用现状进行较系统的阐述，希望能够为广大中药研究者提供有益的参考和借鉴。
1基于配体的预测方法
基于配体的预测方法主要包括化学相似性搜索、药效团模型。基于化学相似性的预测方法基本理论是，具有化学相似性的配体，也具有类似的生化活性，即可以结合相似的靶标，从而确定靶标蛋白之间的关联性，预测药物靶标[5]。药效团是指配体对靶标蛋白识别起关键作用的分子结构要素，包括氢键受体、氢键供体、疏水基团等。基于药效团的药物筛选是利用特定靶点活性的药效团模型在化合物数据库中进行三维结构筛选，可与之相匹配的化合物具有与药效团相应的潜在靶点活性[6]。
1.1化学相似性搜索(chemical similarity research)化学相似性搜索利用化学描述符，将配体小分子的结构或其他信息数学化，并用一串可比较的数字描绘一个配体小分子来计算2个配体分子之间的化学相似性[5] ......
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1基于配体的预测方法
基于配体的预测方法主要包括化学相似性搜索、药效团模型。基于化学相似性的预测方法基本理论是，具有化学相似性的配体，也具有类似的生化活性，即可以结合相似的靶标，从而确定靶标蛋白之间的关联性，预测药物靶标[5]。药效团是指配体对靶标蛋白识别起关键作用的分子结构要素，包括氢键受体、氢键供体、疏水基团等。基于药效团的药物筛选是利用特定靶点活性的药效团模型在化合物数据库中进行三维结构筛选，可与之相匹配的化合物具有与药效团相应的潜在靶点活性[6]。
1.1化学相似性搜索(chemical similarity research)化学相似性搜索利用化学描述符，将配体小分子的结构或其他信息数学化，并用一串可比较的数字描绘一个配体小分子来计算2个配体分子之间的化学相似性[5] ......
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