基于iTRAQ技术结合2D—LC—MS/MS研究黄连对CYP450同工酶表达的影响(3)
2.6 数据库搜索 采用ProteinPilotTM 4.5和DAVID Bioinformatics Resources 6.7分析差异蛋白的生物过程、分子功能和代谢通路。Cytoscape 3.2.0，IntAct[15]和MINT[16]对差异蛋白进行蛋白相互作用分析。
3 结果
3.1 2D LC-MS/MS定量 CYP450酶 采用ProteinPilotTM Software 4.5筛选鉴定差异蛋白。差异蛋白必须满足2个条件：筛选的差异表达的蛋白具有2个或以上特异性肽段。理论上，每个蛋白都有消化后所得出的不同肽段，这些肽段的质量(相对分子质量)就是这个蛋白的肽指纹图。当一个未知蛋白被酶解，用质谱可以检测出几乎所有肽段的质量。然后把这些质量与数据库中已知的所有蛋白指纹进行匹配；差异蛋白质的变化比率上调1.2倍以上或者下调0.6倍以上。CYP2A1质谱图见图1。根据上述差异蛋白筛选要求，黄连与空白组比较共鉴定出15个差异蛋白，见表1。
3.2 黄连组差异蛋白显著性功能分析 采用DAVID 6.7软件 ......
您现在查看是摘要页，全文长 4249 字符。
3 结果
3.1 2D LC-MS/MS定量 CYP450酶 采用ProteinPilotTM Software 4.5筛选鉴定差异蛋白。差异蛋白必须满足2个条件：筛选的差异表达的蛋白具有2个或以上特异性肽段。理论上，每个蛋白都有消化后所得出的不同肽段，这些肽段的质量(相对分子质量)就是这个蛋白的肽指纹图。当一个未知蛋白被酶解，用质谱可以检测出几乎所有肽段的质量。然后把这些质量与数据库中已知的所有蛋白指纹进行匹配；差异蛋白质的变化比率上调1.2倍以上或者下调0.6倍以上。CYP2A1质谱图见图1。根据上述差异蛋白筛选要求，黄连与空白组比较共鉴定出15个差异蛋白，见表1。
3.2 黄连组差异蛋白显著性功能分析 采用DAVID 6.7软件 ......
您现在查看是摘要页，全文长 4249 字符。