基于新疆紫草转录组的对羟基苯甲酸香叶基转移酶(PGT)
32新疆紫草6个AePGTs基因编码蛋白特性分析
利用Protparam在线工具对本实验获得的6个AePGTs基因的编码蛋白序列进行基本理化性质预测(表2)。利用CDD数据库分析结构域，结果表明6个AePGTs均具有UbiA异戊烯基转移酶家族保守结构域，该家族蛋白主要功能是将异戊烯供体转移到芳香化合物受体被活化的C原子上，参与泛醌、甲萘醌、质体醌等化合物的生物合成。PROSITE分析结果进一步表明6个AePGTs中均具有UbiA异戊烯基转移酶家族标签(图2)，此标签序列中包含膜结合型芳香族异戊烯基转移酶所具有的异戊烯焦磷酸结合区(N/D)DxxDxxxD。Psortb预测结果显示6个AePGTs均定位在细胞质膜上(cytoplasmic membrane)，同时SignalP41 Server和TargetP 11 Server软件分析结果显示6个AePGTs均无线粒体信号肽，而这既是它们与已知的3个PGTs，LePGT1，LePGT2以及AePGT的共性，同时也是PGT有别于其他植物来源的的对羟基苯甲酸多异戊烯转移酶(phydroxybenzoate polyprenyltransferase ......
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利用Protparam在线工具对本实验获得的6个AePGTs基因的编码蛋白序列进行基本理化性质预测(表2)。利用CDD数据库分析结构域，结果表明6个AePGTs均具有UbiA异戊烯基转移酶家族保守结构域，该家族蛋白主要功能是将异戊烯供体转移到芳香化合物受体被活化的C原子上，参与泛醌、甲萘醌、质体醌等化合物的生物合成。PROSITE分析结果进一步表明6个AePGTs中均具有UbiA异戊烯基转移酶家族标签(图2)，此标签序列中包含膜结合型芳香族异戊烯基转移酶所具有的异戊烯焦磷酸结合区(N/D)DxxDxxxD。Psortb预测结果显示6个AePGTs均定位在细胞质膜上(cytoplasmic membrane)，同时SignalP41 Server和TargetP 11 Server软件分析结果显示6个AePGTs均无线粒体信号肽，而这既是它们与已知的3个PGTs，LePGT1，LePGT2以及AePGT的共性，同时也是PGT有别于其他植物来源的的对羟基苯甲酸多异戊烯转移酶(phydroxybenzoate polyprenyltransferase ......
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