基于系统药理学探索甘草有效成分甘草甜素的药理作用机制(2)
12作用靶点查询甘草甜素相关基因或蛋白质通过应用Polysearch系统和PubChem数据库获得。PubChem是有机小分子生物活性数据库,存储数以百万计的有机小分子以及生物活性、生物实验数据[7]。在Polysearch系统和PubChem数据库中查询甘草甜素的靶蛋白,人工阅读抽提语句以校正。
13蛋白质相互作用网络的构建以甘草甜素相关的靶蛋白名为检索词,从分子相互作用数据库 BIND(https://wwwiscorg/downloads/bind/),BioGRID(http://thebiogridorg/),DIP (http://dipdoembiuclaedu/dip/Maincgi),HPRD(http://hprd. org/),IntAct(http://wwwebiacuk/intact/),MINT(http://mintbiouniroma2it/mint/)中进行检索,并用Agilent Literature Search(http://appscytoscape. org/apps/agilentliteraturesearch)文本挖掘工具从文献中获得它们之间相互作用蛋白质的信息 ......
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