基于GC TOF MS研究威灵仙总皂苷对佐剂性关节炎大鼠血清代谢谱的影响(3)
23 潜在生物标志物的鉴定 通过PLSDA分析后,结合变量重要性投影值(variable importance projection,VIP)及P<005筛选出潜在的生物标志物。经模式识别与特征代谢物的提取得到引起组间差异的主要潜在生物标志物所对应的保留时间,再根据变量对应的保留时间,得到其质谱图。利用LECOFiehn Rtx5 数据库对潜在生物标志物进行结构鉴定,并将其串联质谱数据,在数据库HMDB (http://wwwhmdbca/)中进行检索和确认,共鉴定出17个潜在的生物标志物,见表1。
为直观反映潜在生物标志物在各组中相对浓度的变化情况,绘制了17个潜在生物标志物的箱式图,见图5。结果显示,与正常组相比,2羟基丁酸、天冬氨酸、乙醇胺、肌醇、胸腺嘧啶和反式4羟基L脯氨酸等在模型组中明显升高,柠檬酸、棕榈醇、苯乙醛和棕榈油酸等在模型组明显降低。经TSCR干预后,上述17个差异化合物都有向正常水平靠近的趋势,说明TSCR对AA大鼠代谢的调节作用。
24 代谢通路网络图
通过查阅文献和KEGG(http://www genomejp/kegg/)网上数据库,将筛选出的潜在生物标志物构建代谢通路图 ......
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为直观反映潜在生物标志物在各组中相对浓度的变化情况,绘制了17个潜在生物标志物的箱式图,见图5。结果显示,与正常组相比,2羟基丁酸、天冬氨酸、乙醇胺、肌醇、胸腺嘧啶和反式4羟基L脯氨酸等在模型组中明显升高,柠檬酸、棕榈醇、苯乙醛和棕榈油酸等在模型组明显降低。经TSCR干预后,上述17个差异化合物都有向正常水平靠近的趋势,说明TSCR对AA大鼠代谢的调节作用。
24 代谢通路网络图
通过查阅文献和KEGG(http://www genomejp/kegg/)网上数据库,将筛选出的潜在生物标志物构建代谢通路图 ......
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