太子参分解代谢关键酶8′羟化酶基因的克隆及生物信息学分析(1)
[摘要] ABA 8′羟化酶是脱落酸(abscisic acid，ABA)分解代谢中的关键酶基因之一。采用同源检索的方法从太子参转录组数据库中获得7个ABA 8′羟化酶(abscisic acid 8′-hydroxylase)基因家族成员，对各家族成员进行转录分析组数据以及ABA 8′羟化酶关键基因ABA8ox1编码区(coding sequence，CDS)的克隆与生物信息学分析。ABA8ox1基因CDS全长1 401 bp，编码480个氨基酸残基，等电点为8.55，相对分子质量为53 kDa，跨膜分析显示其为膜蛋白，1～21个氨基酸残基位于胞内，22～466个氨基酸残基位于胞外。转录组数据分析及定量PCR技术共同证明ABA8ox1在块根的韧皮部及须根中有较高的表达。多序列比对及聚类分析显示与其他植物CYP707A蛋白具有较高的同源性 ......
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