太子参类胡萝卜素双加氧裂解酶家族4成员的克隆及表达特性分析(1)
[摘要] 为探讨太子参环肽成分与品质形成的分子机制，利用生物信息学方法从太子参转录组数据库中筛选出太子参类胡萝卜素双加氧裂解酶(carotenoid cleavage dioxygenases，CCDs)新基因，并设计引物对其进行全长扩增及克隆、生物信息学分析和基因表达分析。克隆得到的4条CCDs序列全长分别为1 617，1 461，1 746，1 875 bp，并根据其功能依次命名为PhCCD1，PhNCED2，PhNCED3，PhCCD4。序列分析结果表明，4个基因均含有REP65结构域，且均含有与亚铁离子结合的位点。系统进化分析表明，PhNCED2，PhNCED3聚为NCEDs一支，PhCCD1，PhCCD4聚为CCDs一支，且与拟南芥Arabidopsis thaliana的AtCCDs家族相比 ......
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