花叶型与艾叶型乌头叶片基因组DNA甲基化修饰的MSAP分析(2)
1.4 引物序列 本次实验所用引物和接头由北京华大基因公司合成,具体名称及核苷酸序列见表1。
2 方法
2.1 乌头叶片基因组DNA的提取 本实验中乌头叶片总DNA提取使用天根公司的植物基因组提取试剂盒(离心柱型,CAT DP305),并按照试剂盒说明书步骤逐步完成基因组DNA 提取。
2.2 EcoRⅠ/ HpaⅡ及EcoRⅠ/MspⅠ双酶切 EcoRⅠ及HpaⅡ/MspⅠ接头引物等体积混合,配置成终浓度为50 μmol·L-1的混合液,混合液于94 ℃变性10 min 后进行自然降温以进行2条引物的复性配对,使单链复性成双链DNA,再进行双酶切,设置酶切时间分别为4,8,12,16,24 h以确定最佳的双酶切时间。酶切反应总体系20 μL:EcoRⅠenzyme(10 U·μL-1)0.5 μL,HpaⅡenzyme(10 U·μL-1)
0.1 μL或MspⅠenzyme(10 U·μL-1)0.3 μL ......
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2 方法
2.1 乌头叶片基因组DNA的提取 本实验中乌头叶片总DNA提取使用天根公司的植物基因组提取试剂盒(离心柱型,CAT DP305),并按照试剂盒说明书步骤逐步完成基因组DNA 提取。
2.2 EcoRⅠ/ HpaⅡ及EcoRⅠ/MspⅠ双酶切 EcoRⅠ及HpaⅡ/MspⅠ接头引物等体积混合,配置成终浓度为50 μmol·L-1的混合液,混合液于94 ℃变性10 min 后进行自然降温以进行2条引物的复性配对,使单链复性成双链DNA,再进行双酶切,设置酶切时间分别为4,8,12,16,24 h以确定最佳的双酶切时间。酶切反应总体系20 μL:EcoRⅠenzyme(10 U·μL-1)0.5 μL,HpaⅡenzyme(10 U·μL-1)
0.1 μL或MspⅠenzyme(10 U·μL-1)0.3 μL ......
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