基于NanoLCLTQOrbitrap技术的蛋白质组学法探索人参干预“气虚”大鼠的生物学基础(2)
2.2.3 多肽的除盐及冻干 将酶解完的样品按照Pierce C18 Spin Columns说明书中的步骤进行脱盐处理,最后将多肽洗脱液用离心浓缩仪进行冷冻干燥,-20 ℃保存备用。
2.2.4 样品检测 用0.1%甲酸溶液80 μL溶解样品,NanoLCLTQOrbirap联用系统对蛋白样品进行检测。
色谱条件:分析柱为EASYSpray C18色谱柱(75 μm×15 cm,3 μm),预柱为Acclaim PepMap 100(C18,75 μm×2 cm,3 μm)。流动相A为0.1%甲酸水,流动相B为0.1%甲酸乙腈。进样量2 μL,流速300 nL·min-1,柱温40 ℃。蛋白样品流动相浓度梯度见表1。
LTQ Orbitrap Elite质谱条件:正离子模式,喷雾电压1.9 kV,毛细管温度250 ℃。一级图谱开启FTMS扫描模式,二级图谱35%的碰撞能量,采用Ion trap1拖20的扫描模式,扫描范围300~1 800。
2.3 数据分析方法
将LCMS所收集到的RAW文件导入Protein Discovery软件进行蛋白质鉴定,再运用SIEVE软件对不同组别的蛋白进行相对定量定性分析。
3 结果
3.1 LCMS总离子流图
与空白组相比较,气虚模型组大鼠样本的TIC图从外观上有一定差异;与气虚模型组相比较,人参组大鼠样本的TIC图也有一定差异 ......
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2.2.4 样品检测 用0.1%甲酸溶液80 μL溶解样品,NanoLCLTQOrbirap联用系统对蛋白样品进行检测。
色谱条件:分析柱为EASYSpray C18色谱柱(75 μm×15 cm,3 μm),预柱为Acclaim PepMap 100(C18,75 μm×2 cm,3 μm)。流动相A为0.1%甲酸水,流动相B为0.1%甲酸乙腈。进样量2 μL,流速300 nL·min-1,柱温40 ℃。蛋白样品流动相浓度梯度见表1。
LTQ Orbitrap Elite质谱条件:正离子模式,喷雾电压1.9 kV,毛细管温度250 ℃。一级图谱开启FTMS扫描模式,二级图谱35%的碰撞能量,采用Ion trap1拖20的扫描模式,扫描范围300~1 800。
2.3 数据分析方法
将LCMS所收集到的RAW文件导入Protein Discovery软件进行蛋白质鉴定,再运用SIEVE软件对不同组别的蛋白进行相对定量定性分析。
3 结果
3.1 LCMS总离子流图
与空白组相比较,气虚模型组大鼠样本的TIC图从外观上有一定差异;与气虚模型组相比较,人参组大鼠样本的TIC图也有一定差异 ......
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