红花生育酚环化酶基因的克隆及表达分析(3)

http://www.100md.com 2016年10月15日 《中国中药杂志》2016年第20期

     3.4 CtTC蛋白二级结构、跨膜区、亚细胞定位、糖基化位点预测分析 采用SWISS-MODEL(http：//npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/secpred_sopm.pl) SOPMA 进行CtTC基因的编码蛋白二级结构分析和结构域预测(http：//npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/ npsa_automat.pl？page=npsa_sopm.html)。CtTC的编码蛋白二级结构中α-螺旋 (alpha helix) 占20.9%、延伸链 (extended strand)占24.26%、β-折叠(beta turn)占14.4%、无规卷曲 (random coil)占40.43%(图3)。

    跨膜螺旋分析(http：//www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/)表明该蛋白为膜外蛋白。在线工具WOLF PSORT (http：//wolfpsort.org/)预测该蛋白的亚细胞定位情况如下：chlo：8.0 ......