药用植物代谢组学研究(4)
随着首个药用植物——丹参基因组框架图的完成[30]，将进一步推动丹参成为模式药用植物，也为系统揭示丹参次生代谢奠定坚实基础。目前，在多数植物无法进行全基因组序列测定的情况下，转录组研究已经成为分离和克隆新基因及基因功能研究的重要手段之一[31]。Gao Wei 等使用UPLCDADQTOFMS非靶向代谢组学技术分析银离子诱导的丹参毛状根，鉴定了5个明显差异的丹参酮类代谢物。转录组分析鉴定了6 358个差异基因，通过分析明显上调的富集基因，预测了70个候选的转录因子和8个P450氧化还原酶，它们可能与银离子诱导的丹参酮类物质合成相关[32]。
传统分子生物学手段克隆、验证代谢功能基因，是一份具有挑战的工作。基于联锁关联分析的代谢组学分析成为大规模、高效定位代谢物合成基因的新手段。在植物学研究领域，全基因组关联分析(genomewide association studies， GWAS)是在全基因组范围内筛选不同遗传差异个体分子标记的基础上，分析表型相关联的分子标记位点。GWAS广泛用于人类疾病与植物复杂农艺性质遗传基础的解析。GWAS结合代谢组学技术(metabolic GWAS， mGWAS)则用以解析代谢物合成的遗传机制，即代谢合成及调控的基因位点。Chen 等对524份自然栽培水稻品种资源(含有642.877万的SNPs分子标记)进行LCMS代谢组学分析 ......
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传统分子生物学手段克隆、验证代谢功能基因，是一份具有挑战的工作。基于联锁关联分析的代谢组学分析成为大规模、高效定位代谢物合成基因的新手段。在植物学研究领域，全基因组关联分析(genomewide association studies， GWAS)是在全基因组范围内筛选不同遗传差异个体分子标记的基础上，分析表型相关联的分子标记位点。GWAS广泛用于人类疾病与植物复杂农艺性质遗传基础的解析。GWAS结合代谢组学技术(metabolic GWAS， mGWAS)则用以解析代谢物合成的遗传机制，即代谢合成及调控的基因位点。Chen 等对524份自然栽培水稻品种资源(含有642.877万的SNPs分子标记)进行LCMS代谢组学分析 ......
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