天然产物生物合成途径解析策略(2)
鉴于大多数天然产物都具有共同的上游代谢途径,并且已研究得比较透彻,因此,对于某个或某类特定天然产物生物合成途径的解析通常是指对其下游特异性分支代谢途径的解析。天然产物生物合成途径解析的一般策略是:首先根据化学反应原理和已分离鉴定的中间产物推测出可能的生物合成途径,必要时可通过同位素示踪对推测途径进行进一步的确认;然后通过转录组分析获得相关基因的共表达信息,或通过基因组扫描发掘次生代谢相关的基因簇,从而发现并缩小候选基因的范围;最后对所有候选基因进行异源表达和酶活性检测确定酶的催化功能,对于遗传转化体系成熟的物种,可在原物种中进行酶基因的抑制或过表达研究,进一步确认该酶在原物种体内的功能(图2)。通过对途经中所有酶的发掘和功能确认,最终达到途径解析的目的。
1 代谢途径推测
根据已有的知识推测出一个可能的代谢途径是天然产物生物合成途径解析的第一步。化学反应原理和机制,已分离得到中间产物的化学结构等都可以为合成途径推测提供有用的线索。同位素示踪法常被用于对途径进行进一步的确认和校正。同位素标记的化合物与非标记化合物具有相同的生物学和化学性质,但是具有不同的质量,可以通过质谱仪和核磁共振仪等质量分析仪器来区分它们 ......
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1 代谢途径推测
根据已有的知识推测出一个可能的代谢途径是天然产物生物合成途径解析的第一步。化学反应原理和机制,已分离得到中间产物的化学结构等都可以为合成途径推测提供有用的线索。同位素示踪法常被用于对途径进行进一步的确认和校正。同位素标记的化合物与非标记化合物具有相同的生物学和化学性质,但是具有不同的质量,可以通过质谱仪和核磁共振仪等质量分析仪器来区分它们 ......
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