基于454 ESTs的麻黄转录组研究(1)
[摘要] 该研究应用454 GS FLX Titanium高通量测序技术对5年生草麻黄Ephedra sinica的草质茎进行转录组测序，共获得48 389条表达序列标签(express sequence tags，ESTs)，序列平均长度为373 bp。所得序列与GenBank中麻黄的EST合并拼接，获得18 801条一致性序列(unigene)。通过与公共数据库中的序列进行同源性比较分析对所得转录本进行功能注释，结果表明其中56.0%(10 531条)的unigenes与其他生物的已知基因具有一定程度的同源性。进一步分析获得了19条可能参与麻黄生物碱生物合成的序列(共编码9个关键酶)，97条细胞色素P450序列，以及大量转录因子序列。该研究为麻黄生物碱类化合物的生物合成研究奠定了基础 ......
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