长春花密码子使用偏好性分析(2)
密码子偏好性在基因的异源表达研究方面具有重要的作用。基因的表达量越高，密码子偏好性越强[1112]，根据这一原则，可以替换基因的低效密码子来提高外源基因的表达，还可以根据密码子使用的偏好性选择合适的宿主表达系统。研究密码子偏好性能对分子水平的基因预测，分类和进化提供重要的信息。
本文对长春花的密码子使用偏好性进行了系统研究， 并对长春花中TIAs 合成途径25个关键酶编码基因的密码子偏好性与大肠杆菌和酵母基因组的密码子偏好性进行比较，以期为基因表达选择合适的表达系统。
1 材料与方法
1.1 数据来源 长春花基因组数据参见文献[13]，通过编写Perl语言程序对数据进行筛选，共筛选出碱基数大于等于300 bp的蛋白质编码序列 (coding sequence， CDS) 30 437条，作为密码子分析的数据来源。本文所采用的大肠杆菌、酵母基因组的密码子偏好性数据来源于Codon Usage database(http：//www.kazusa.or.jp/codon/)。
长春花TIA合成途径中已被鉴定的25个关键酶编码基因序列的NCBI登录号分别为：AY352047.1 ......
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本文对长春花的密码子使用偏好性进行了系统研究， 并对长春花中TIAs 合成途径25个关键酶编码基因的密码子偏好性与大肠杆菌和酵母基因组的密码子偏好性进行比较，以期为基因表达选择合适的表达系统。
1 材料与方法
1.1 数据来源 长春花基因组数据参见文献[13]，通过编写Perl语言程序对数据进行筛选，共筛选出碱基数大于等于300 bp的蛋白质编码序列 (coding sequence， CDS) 30 437条，作为密码子分析的数据来源。本文所采用的大肠杆菌、酵母基因组的密码子偏好性数据来源于Codon Usage database(http：//www.kazusa.or.jp/codon/)。
长春花TIA合成途径中已被鉴定的25个关键酶编码基因序列的NCBI登录号分别为：AY352047.1 ......
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