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编号:12985382
长春花密码子使用偏好性分析(3)
http://www.100md.com 2016年11月15日 《中国中药杂志》2016年第22期
     为了更直观地预测长春花基因在宿主大肠杆菌和酵母中的表达情况,选取25个已被鉴定的长春花TIAs合成途径关键酶编码基因,分别计算其基因序列中大肠杆菌和酿酒酵母稀有密码子所占比例。大肠杆菌稀有密码子在TIAs基因中所占比例明显高于酿酒酵母稀有密码子(图1),比值为:大肠杆菌4.167%~9.615%,酿酒酵母1.437%~6.319%,这表明长春花TIAs合成途径酶基因在大肠杆菌中表达可能会受到较大的限制。因此若需将TIAs基因在大肠杆菌中表达,可以根据密码子偏性部分改造密码子,来适应大肠杆菌的密码子使用偏好性,从而提高表达效率。

    3 讨论

    本研究首先对长春花基因组的密码子组成、密码子偏性进行了综合分析,发现长春花主要偏爱使用以A和T结尾的密码子,且相比于酿酒酵母,其密码子使用特点与大肠杆菌的差异更大。虽然影响外源基因在宿主中表达的因素较多, 但是密码子的选用是影响表达的重要因素之一,选择密码子偏性相近的宿主 ......
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