1材料与方法

    11试验材料及RNA提取试验材料采集于河南宛西药业股份有限公司南阳西峡山茱萸GAP种植基地，选取长势良好的健康果实，经液氮速冻后保存于实验室超低温冰箱中备用。采用Trizol 法提取果实的总RNA，用于转录组测序。分别采用Nanodrop，Qubit 20，Aglient 2100方法检测RNA样品的纯度、浓度和完整性等，以保证使用合格的样品进行转录组测序。

    12转录组测序及数据组装使用上述检测合格后的总RNA样品进行文库构建。库检合格后，使用Illumina HiSeq2500测序平台进行高通量测序，测序读长为PE125。测序得到的原始图像数据经碱基识别转化为原始读序，所有的原始读序(raw reads)通过去除接头、重复序列、低质量的序列，得到干净读序(clean reads)。使用Trinity 拼接干净读序得到重叠群(contigs)。在所有的转录本中，取最长的contig作为该转录本的转录本(unigene)。

    13功能注释通过BLAST比对软件将所获得的山茱萸unigene序列与NR(Nonredundant Protein Sequence Database in GenBank ......