白虎加桂枝汤对热痹模型大鼠特征性甲基化基因表达的影响(4)
344热痹差异性甲基化基因相关KEGG Pathway分析将RB相对AA的差异性基因投射于KEGG Pathway公共数据库[7]上,通过pathway显著性富集分析,得到RB相对AA的差异性 KEGG通路。由结果可知,RB差异性甲基化基因主要富集到细胞黏附、钙信号途径、MAPK信号通路、T,B细胞受体信号通路、抗原提呈处理等32个通路上。结果见表4。345热痹特征性甲基化基因采用整合基因组学浏览器(IGV)检测MeDIPSeq测序的原始数据中的wig压缩包,剔除组内3个样本在peak相同区域内存在较大差异的甲基化基因,再经过取差集的方法筛选启动子区发生差异性甲基化的基因后,分析方法见图5,得到热痹特征性甲基化下调基因36个,甲基化上调基因16个。热痹特征性甲基化基因见表5。
35白虎加桂枝汤对热痹模型特征性甲基化基因表达的影响
检测白虎加桂枝汤不同剂量对热痹特征性甲基化上调基因AGXT及甲基化下调基因AHCY和RPL3 3个基因mRNA表达水平的影响。结果表明与RB比较,BHG与BLG均能降低Ahcy基因mRNA表达水平;BHG ......
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